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万晓耕

研究方向:时间序列因果算法、深度因果算法与因果大模型、因果博弈、生物复杂网络、生物信息、几何深度学习、拓扑数据分析、几何拓扑表示学习、生物分子结构建模、网络拓扑、因果几何、信息几何、互信息估计、人工智能算法

讲师

学历:博士研究生毕业

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  • 电子邮箱: 2017500011(at)buct.edu.cn
  • 办公地址: 昌平校区文理楼316

个人简介

   万晓耕目前为北京化工大学数理学院数学部讲师,2010年本科毕业于北京科技大学数学力学系信息与计算科学专业,2012年硕士毕业于英国杜伦大学(Durham University)数学系,获得杜伦大学优秀硕士学位(MSc awarded with Distinction Honor,微分几何方向),2015年博士毕业于英国伦敦帝国理工学院(Imperial College London)数学系(复杂网络与因果推断方向),并于2015-2017年间在清华大学数学科学系从事博士后研究(生物复杂网络、生物信息方向)。

   万晓耕老师主要从事线性代数、概率论与数理统计、科技英语、研究生学术英语读写、复杂网络与因果推断等课程的教学,曾主持化工与线性代数交叉融合教改项目1项;参与数学建模竞赛的培训、统计建模竞赛的评阅,曾指导学生参加美国大学生数学建模竞赛获得F奖(特等奖提名)、一等奖、二等奖,以及亚太杯数学建模竞赛一等奖;本人曾获本科毕业设计优秀指导教师称号,指导多名本科生毕业设计获得校级优秀,指导1名本科生以第一作者发表中文核心论文1篇

   万晓耕老师主要从事时间序列因果算法、深度因果算法与因果大模型、因果博弈、生物复杂网络、几何深度学习、拓扑数据分析、几何拓扑表示学习、生物分子几何拓扑结构建模、生物信息、人工智能算法等研究,也涉及因果几何、信息几何、医学图像、整合信息分解、因果涌现、网络拓扑、互信息估计、复杂系统等相关方向的研究。本人主持中央高校基本科研业务费项目1项(生物分子几何建模研究),参与国家重点研发计划项目1项,以第一作者及通讯作者发表SCI、EI及核心学术论著十余篇,其中包括参与撰写复杂性科学与生物信息领域英文专著两部:《Edward Elgar Handbook of Complexity Sciences》(Edward Elgar Publishing, UK)与《Bioinformatics--Recent Advances》(IntechOpen Publishing, UK;本人独立撰写该书的章节);参加国内国际学术会议10余次,并在多个国际学术会议上做过会议报告与墙报展示。

   万晓耕老师担任Computational Biology and Bioinformatics期刊审稿人,以及2025第二届信息处理与智能感知高峰论坛--知识处理与表示专题的专题委员曾受PLOS ONE、BMC Bioinformatics、EURASIP Journal on Advances in Signal Processing、International Journal of Biomathematics、International Journal of Data Science and Analytics、Pattern Analysis and Applications(Springer Nature)等SCI期刊、Qieos学术平台,以及International Symposium on Automation, Information and Computing学术会议邀请作审稿人。

   万晓耕老师主要关注时间序列因果算法深度因果算法与因果大模型、因果博弈、生物复杂网络、生物信息、几何深度学习、拓扑数据分析、几何拓扑表征、网络拓扑及人工智能算法,对基于人工智能算法的因果推断、几何深度学习、拓扑数据分析、几何拓扑表征学习算法以及生物分子结构建模、网络拓扑、因果几何、信息几何等交叉学科研究方向具有强烈的研究兴趣,也涉猎医学图像、整合信息分解、因果涌现、网络拓扑、复杂系统、医学图像等AI for Science交叉研究。

   万晓耕老师非常欢迎交叉学科研究合作!

教育经历

入学时间 毕业时间 学位授予单位 学历
2011-10-01 2015-01-01 Imperial College London 博士研究生毕业
2010-10-01 2011-09-01 Durham University 硕士研究生毕业
2006-09-01 2010-07-01 北京科技大学 大学本科毕业

工作经历

起始年月 截止年月 所在单位名称
2019-03-01 至今 北京化工大学
2017-05-15 2019-02-28 北京化工大学
2015-04-27 2017-04-27 清华大学

社会职务

万晓耕老师担任Computational Biology and Bioinformatics期刊审稿人,以及2025第二届信息处理与智能感知高峰论坛--知识处理与表示专题的专题委员曾受PLOS ONE、BMC Bioinformatics、EURASIP Journal on Advances in Signal Processing、International Journal of Biomathematics、International Journal of Data Science and Analytics、Pattern Analysis and Applications(Springer Nature)等SCI期刊、Qieos学术平台以及International Symposium on Automation, Information and Computing学术会议邀请作审稿人。

社会活动

研究领域

   万晓耕老师主要关注深度因果算法与因果大模型、深度因果算法与因果大模型、因果博弈、生物复杂网络、生物信息、几何深度学习、拓扑数据分析、几何拓扑表征、网络拓扑及人工智能算法,对基于人工智能算法的因果推断、几何深度学习、拓扑数据分析、几何拓扑表征学习算法以及生物分子结构建模、网络拓扑、因果几何、信息几何等交叉学科研究方向具有强烈的研究兴趣,也涉猎医学图像、整合信息分解、因果涌现、网络拓扑、复杂系统、医学图像等AI for Science交叉研究。

   万晓耕老师非常欢迎交叉学科研究合作!

本科生课程

课程名称 开课学年 课程总学时 选课人数 课程性质
线性代数A 2025 56 183 公共基础必修
线性代数A 2025 56 153 公共基础必修
科技英语 2024 32 46 公共基础选修
科技英语 2024 32 30 公共基础选修
概率论与数理统计B 2024 48 156 公共基础必修
概率论与数理统计B 2024 48 167 公共基础必修
概率论与数理统计B 2024 48 122 公共基础必修
概率论与数理统计B 2024 48 60 公共基础必修
概率论与数理统计B 2024 48 57 专业必修
线性代数A 2024 56 160 公共基础必修
线性代数A 2024 56 194 公共基础必修
科技英语 2023 32 72 公共基础选修
科技英语 2023 32 57 公共基础选修
概率论与数理统计B 2023 48 188 公共基础必修
概率论与数理统计B 2023 48 122 公共基础必修
科技英语 2022 32 26 专业选修
科技英语 2022 32 82 公共基础选修
科技英语 2022 32 29 公共基础选修
概率论与数理统计B 2022 48 119 公共基础必修
概率论与数理统计B 2022 48 126 公共基础必修
科技英语 2021 32 20 专业选修
科技英语 2021 32 107 专业选修
科技英语 2021 32 83 专业选修
概率论与数理统计B 2021 48 123 公共基础必修
概率论与数理统计 2021 48 157 公共基础必修
复变函数与积分变换 2021 48 85 专业必修
复变函数与积分变换 2021 48 36 专业选修
概率论与数理统计 2020 56 176 公共基础必修
复变函数与积分变换 2020 48 24 专业选修
复变函数与积分变换 2020 48 66 专业必修

研究生课程

课程名称 开课学年 总学时 开课方式
泛函分析(数学专业) 2025 64 D专业选修课
学术英语读写 2025 32 A公共基础课
泛函分析(数学专业) 2024 64 D专业选修课
泛函分析(数学专业) 2023 64 D专业选修课
泛函分析(数学专业) 2022 64 D专业选修课
泛函分析(数学专业) 2021 64 D专业选修课
泛函分析(数学专业) 2020 64 D专业选修课
泛函分析(数学专业) 2019 64 D专业选修课
泛函分析(数学专业) 2018 64 D专业选修课
泛函分析(数学专业) 2017 64 D专业选修课

校级项目

纵向项目

横向项目

论文信息

[+][-]代表性论文
  • 1. DOI 万晓耕,谭新颖
    Identifying sequential differences between protein structural classes using network and statistical approaches[期刊论文],Molecular & Cellular Biomechanics,2024-12-16
  • 2. DOI 万晓耕,谭新颖,曹珺
    A Study on Novel Amino Acid Pair Features for Protein Evolutionary Classifications[期刊论文],Computational Biology and Bioinformatics,2024-09-23
  • 3. DOI 戚添韵;万晓耕
    基于序列特征网络的蛋白质结构类型研究[期刊论文],生物信息学.,2021-11-23
  • 4. DOI 万晓耕,谭新颖
    A protein structural study based on the centrality analysis of protein sequence feature networks[期刊论文],PLoS One,2021-03-29
  • 5. DOI 万晓耕
    基于 K-mer 扭转角偏好的蛋白质结构类型预测[期刊论文],生物信息学 Chinese Journal of Bioinformatics,2020-05-26
  • 6. DOI 万晓耕,谭新颖
    A Simple Protein Evolutionary Classification Method Based on the Mutual Relations Between Protein Sequences[期刊论文],Current Bioinformatics,2020-02-18
[+][-] 2030年
  • 1. DOI 万晓耕,谭新颖
    Identifying sequential differences between protein structural classes using network and statistical approaches[期刊论文],Molecular & Cellular Biomechanics,2024-12-16
  • 2. DOI 万晓耕,谭新颖,曹珺
    A Study on Novel Amino Acid Pair Features for Protein Evolutionary Classifications[期刊论文],Computational Biology and Bioinformatics,2024-09-23
  • 3. DOI 戚添韵;万晓耕
    基于序列特征网络的蛋白质结构类型研究[期刊论文],生物信息学.,2021-11-23
  • 4. DOI 万晓耕,谭新颖
    A protein structural study based on the centrality analysis of protein sequence feature networks[期刊论文],PLoS One,2021-03-29
  • 5. DOI 万晓耕
    基于 K-mer 扭转角偏好的蛋白质结构类型预测[期刊论文],生物信息学 Chinese Journal of Bioinformatics,2020-05-26
  • 6. DOI 万晓耕,谭新颖
    A Simple Protein Evolutionary Classification Method Based on the Mutual Relations Between Protein Sequences[期刊论文],Current Bioinformatics,2020-02-18
[+][-] 2029年
  • 1. DOI 万晓耕,谭新颖
    Identifying sequential differences between protein structural classes using network and statistical approaches[期刊论文],Molecular & Cellular Biomechanics,2024-12-16
  • 2. DOI 万晓耕,谭新颖,曹珺
    A Study on Novel Amino Acid Pair Features for Protein Evolutionary Classifications[期刊论文],Computational Biology and Bioinformatics,2024-09-23
  • 3. DOI 戚添韵;万晓耕
    基于序列特征网络的蛋白质结构类型研究[期刊论文],生物信息学.,2021-11-23
  • 4. DOI 万晓耕,谭新颖
    A protein structural study based on the centrality analysis of protein sequence feature networks[期刊论文],PLoS One,2021-03-29
  • 5. DOI 万晓耕
    基于 K-mer 扭转角偏好的蛋白质结构类型预测[期刊论文],生物信息学 Chinese Journal of Bioinformatics,2020-05-26
  • 6. DOI 万晓耕,谭新颖
    A Simple Protein Evolutionary Classification Method Based on the Mutual Relations Between Protein Sequences[期刊论文],Current Bioinformatics,2020-02-18
[+][-] 2028年
  • 1. DOI 万晓耕,谭新颖
    Identifying sequential differences between protein structural classes using network and statistical approaches[期刊论文],Molecular & Cellular Biomechanics,2024-12-16
  • 2. DOI 万晓耕,谭新颖,曹珺
    A Study on Novel Amino Acid Pair Features for Protein Evolutionary Classifications[期刊论文],Computational Biology and Bioinformatics,2024-09-23
  • 3. DOI 戚添韵;万晓耕
    基于序列特征网络的蛋白质结构类型研究[期刊论文],生物信息学.,2021-11-23
  • 4. DOI 万晓耕,谭新颖
    A protein structural study based on the centrality analysis of protein sequence feature networks[期刊论文],PLoS One,2021-03-29
  • 5. DOI 万晓耕
    基于 K-mer 扭转角偏好的蛋白质结构类型预测[期刊论文],生物信息学 Chinese Journal of Bioinformatics,2020-05-26
  • 6. DOI 万晓耕,谭新颖
    A Simple Protein Evolutionary Classification Method Based on the Mutual Relations Between Protein Sequences[期刊论文],Current Bioinformatics,2020-02-18
[+][-] 2027年
  • 1. DOI 万晓耕,谭新颖
    Identifying sequential differences between protein structural classes using network and statistical approaches[期刊论文],Molecular & Cellular Biomechanics,2024-12-16
  • 2. DOI 万晓耕,谭新颖,曹珺
    A Study on Novel Amino Acid Pair Features for Protein Evolutionary Classifications[期刊论文],Computational Biology and Bioinformatics,2024-09-23
  • 3. DOI 戚添韵;万晓耕
    基于序列特征网络的蛋白质结构类型研究[期刊论文],生物信息学.,2021-11-23
  • 4. DOI 万晓耕,谭新颖
    A protein structural study based on the centrality analysis of protein sequence feature networks[期刊论文],PLoS One,2021-03-29
  • 5. DOI 万晓耕
    基于 K-mer 扭转角偏好的蛋白质结构类型预测[期刊论文],生物信息学 Chinese Journal of Bioinformatics,2020-05-26
  • 6. DOI 万晓耕,谭新颖
    A Simple Protein Evolutionary Classification Method Based on the Mutual Relations Between Protein Sequences[期刊论文],Current Bioinformatics,2020-02-18
[+][-] 2026年
  • 1. DOI 万晓耕,谭新颖
    Identifying sequential differences between protein structural classes using network and statistical approaches[期刊论文],Molecular & Cellular Biomechanics,2024-12-16
  • 2. DOI 万晓耕,谭新颖,曹珺
    A Study on Novel Amino Acid Pair Features for Protein Evolutionary Classifications[期刊论文],Computational Biology and Bioinformatics,2024-09-23
  • 3. DOI 戚添韵;万晓耕
    基于序列特征网络的蛋白质结构类型研究[期刊论文],生物信息学.,2021-11-23
  • 4. DOI 万晓耕,谭新颖
    A protein structural study based on the centrality analysis of protein sequence feature networks[期刊论文],PLoS One,2021-03-29
  • 5. DOI 万晓耕
    基于 K-mer 扭转角偏好的蛋白质结构类型预测[期刊论文],生物信息学 Chinese Journal of Bioinformatics,2020-05-26
  • 6. DOI 万晓耕,谭新颖
    A Simple Protein Evolutionary Classification Method Based on the Mutual Relations Between Protein Sequences[期刊论文],Current Bioinformatics,2020-02-18
[+][-] 2025年
  • 1. DOI 万晓耕,谭新颖
    Identifying sequential differences between protein structural classes using network and statistical approaches[期刊论文],Molecular & Cellular Biomechanics,2024-12-16
  • 2. DOI 万晓耕,谭新颖,曹珺
    A Study on Novel Amino Acid Pair Features for Protein Evolutionary Classifications[期刊论文],Computational Biology and Bioinformatics,2024-09-23
  • 3. DOI 戚添韵;万晓耕
    基于序列特征网络的蛋白质结构类型研究[期刊论文],生物信息学.,2021-11-23
  • 4. DOI 万晓耕,谭新颖
    A protein structural study based on the centrality analysis of protein sequence feature networks[期刊论文],PLoS One,2021-03-29
  • 5. DOI 万晓耕
    基于 K-mer 扭转角偏好的蛋白质结构类型预测[期刊论文],生物信息学 Chinese Journal of Bioinformatics,2020-05-26
  • 6. DOI 万晓耕,谭新颖
    A Simple Protein Evolutionary Classification Method Based on the Mutual Relations Between Protein Sequences[期刊论文],Current Bioinformatics,2020-02-18
[+][-] 2024年
  • 1. DOI 万晓耕,谭新颖
    Identifying sequential differences between protein structural classes using network and statistical approaches[期刊论文],Molecular & Cellular Biomechanics,2024-12-16
  • 2. DOI 万晓耕,谭新颖,曹珺
    A Study on Novel Amino Acid Pair Features for Protein Evolutionary Classifications[期刊论文],Computational Biology and Bioinformatics,2024-09-23
  • 3. DOI 戚添韵;万晓耕
    基于序列特征网络的蛋白质结构类型研究[期刊论文],生物信息学.,2021-11-23
  • 4. DOI 万晓耕,谭新颖
    A protein structural study based on the centrality analysis of protein sequence feature networks[期刊论文],PLoS One,2021-03-29
  • 5. DOI 万晓耕
    基于 K-mer 扭转角偏好的蛋白质结构类型预测[期刊论文],生物信息学 Chinese Journal of Bioinformatics,2020-05-26
  • 6. DOI 万晓耕,谭新颖
    A Simple Protein Evolutionary Classification Method Based on the Mutual Relations Between Protein Sequences[期刊论文],Current Bioinformatics,2020-02-18
[+][-] 2023年
  • 1. DOI 万晓耕,谭新颖
    Identifying sequential differences between protein structural classes using network and statistical approaches[期刊论文],Molecular & Cellular Biomechanics,2024-12-16
  • 2. DOI 万晓耕,谭新颖,曹珺
    A Study on Novel Amino Acid Pair Features for Protein Evolutionary Classifications[期刊论文],Computational Biology and Bioinformatics,2024-09-23
  • 3. DOI 戚添韵;万晓耕
    基于序列特征网络的蛋白质结构类型研究[期刊论文],生物信息学.,2021-11-23
  • 4. DOI 万晓耕,谭新颖
    A protein structural study based on the centrality analysis of protein sequence feature networks[期刊论文],PLoS One,2021-03-29
  • 5. DOI 万晓耕
    基于 K-mer 扭转角偏好的蛋白质结构类型预测[期刊论文],生物信息学 Chinese Journal of Bioinformatics,2020-05-26
  • 6. DOI 万晓耕,谭新颖
    A Simple Protein Evolutionary Classification Method Based on the Mutual Relations Between Protein Sequences[期刊论文],Current Bioinformatics,2020-02-18
[+][-]2023年之前
  • 1. DOI 万晓耕,谭新颖
    Identifying sequential differences between protein structural classes using network and statistical approaches[期刊论文],Molecular & Cellular Biomechanics,2024-12-16
  • 2. DOI 万晓耕,谭新颖,曹珺
    A Study on Novel Amino Acid Pair Features for Protein Evolutionary Classifications[期刊论文],Computational Biology and Bioinformatics,2024-09-23
  • 3. DOI 戚添韵;万晓耕
    基于序列特征网络的蛋白质结构类型研究[期刊论文],生物信息学.,2021-11-23
  • 4. DOI 万晓耕,谭新颖
    A protein structural study based on the centrality analysis of protein sequence feature networks[期刊论文],PLoS One,2021-03-29
  • 5. DOI 万晓耕
    基于 K-mer 扭转角偏好的蛋白质结构类型预测[期刊论文],生物信息学 Chinese Journal of Bioinformatics,2020-05-26
  • 6. DOI 万晓耕,谭新颖
    A Simple Protein Evolutionary Classification Method Based on the Mutual Relations Between Protein Sequences[期刊论文],Current Bioinformatics,2020-02-18

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专利

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